Linux使用conda安装管理python

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Linux使用conda安装管理python

环境准备

  1. 下载miniconda3

    wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

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  2. 安装

    chmod +x Miniconda3-py310_24.5.0-0-Linux-x86_64.sh  #可以替换成自己上传的文件
bash Miniconda3-py310_24.5.0-0-Linux-x86_64.sh -b -f -p ~/miniconda3 #可以替换成自己上传的文件
source ~/miniconda3/bin/activate

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构建Python环境

  1. 创建python环境

    conda create -n py3.10 python=3.10 -y  #创建名字为py3.10的环境，该环境中的python版本为3.10

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  2. 激活py3.10的环境

    conda activate py3.10

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  3. 安装python库，比如numpy、scipy和matplotlib

    pip install numpy scipy matplotlib -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

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运行程序

  1. 准备python程序

    准备好python源码如下命名为hello.py

    import numpy as np
import scipy
import matplotlib.pyplot as plt

a = np.array([5, 2, 0])
print(f"hello scnet: {a}")

    运行程序，需要使用提交任务的脚本，相应的脚本示例如下，命名为python.slurm。

    #!/bin/bash
#SBATCH -J hello_python                    # 作业的名称 可根据需要自行命名
#SBATCH -p tyhctest                      # 在指定分区中分配资源，根据所拥有的资源修改
#SBATCH -N 1                               # 申请的节点数1个
#SBATCH --ntasks-per-node=4                # 每个节点运行4个任务，使用4个核心

source ~/miniconda3/bin/activate py3.10    #激活python环境

python hello.py

  2. 提交任务

    sbatch python.slurm
# 查看任务
squeue
# 取消任务
scancel 27532270
# 查看结果
cat slurm-11314770.out

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conda 常用命令

命令 说明
conda --version 查看 Conda 版本
conda update conda 更新 Conda 到最新版本
conda create -n env_name python=3.8 创建名为 env_name 的环境，指定 Python 版本
conda activate env_name 激活指定环境
conda deactivate 退出当前环境
conda env list 查看所有环境列表
conda list 查看当前环境中安装的所有包
conda install package_name 安装指定包
conda install package_name=1.2.3 安装指定版本的包
conda update package_name 更新指定包
conda remove package_name 卸载指定包
conda search package_name 搜索可用的包
conda env export > environment.yml 将当前环境导出到 YAML 文件
conda env create -f environment.yml 从 YAML 文件创建环境
conda remove -n env_name --all 删除指定环境及其所有包
conda clean -p 清理未使用的包缓存
conda clean -t 清理临时文件